Ela foi criada a partir da fusão da Faculdade de Ciências Econômicas do Rio de Janeiro, da Faculdade de Direito do Rio de Janeiro, da Faculdade de Filosofia do Instituto Lafayette e da Faculdade de Ciências Médicas. Com o tempo, foram integradas outras instituições, como a Escola Superior de Desenho Industrial (Esdi) e o Hospital Universitário Pedro Ernesto (Hupe). Também foram criadas novas unidades, como o Instituto de Aplicação Fernando Rodrigues da Silveira (CAp-Uerj).